Şəki Xan məscidi kompleksində bərpa işləri çərçivəsində aparılan qazıntılar zamanı tapılan qəbrin Şəki xanına məxsus olduğu təsdiqlənib. Heydər Əliyev Fondu tərəfindən aparılan bərpa işləri zamanı 2021-ci ilin iyun ayında mehrabın altı qazılarkən oradan qəbir aşkar olunub. Laborator analizlərin nəticəsinə, eləcə də AMEA Arxeologiya, Etnoqrafiya və Antro - pologiya İnstitutunun elmi rəyinə əsasən, aşkar edilən qəbir Şəki xanı Məhəmmədhüseyn xana aiddir.